恶就更数不胜数。

土司作威作福肆意统治权可是比皇帝大多了，随心所欲多了。皇帝还要顾忌天下人心。土司不用，敢反抗，直接暴力屠杀。

也就是说，土司的统治总体本质是不受约束的愚昧残暴。

这种挟裹深山民族，做无形中的独立王国，不听王朝管理统治教化，愚昧残暴统治并阻碍少数民族接受文明进化的土司制度一向是时代进步的毒瘤，更是每一代王朝统治者头疼的事，对土司无可奈何，只能威其依附，并不能真正统治教化山区。

这种危害一直延续到解放后很久才慢慢消失。即使到了二十一世纪，中国也仍然时不时遭受一下流亡土司的指控刁难。

由此可见土司制度的祸患之大，遗患之久。